国家发改委将在“十二五”期间对新疆优质棉基地建设投资14．13亿元。这意味着国家对单一省区、单一农作物投资年限最长的一个项目，新疆优质棉基地将继续获得中央财政的大力支持。
今年9月，新疆“十二五”优质棉基地项目可行性研究报告获国家发改委批复，10月初首批优质棉基地建设项目中央预算内投资落实，这标志着新疆“十二五”优质棉基地建设正式启动。
新疆“十二五”优质棉基地建设总投资14．13亿元。支持建设种子质量资源创新与育种研发平台1个，品种选育和良种引进试验基地14个，良繁田30万亩，良种加工生产线9条，新增高产稳产棉田61万亩，高标准节水棉田85万亩，机采棉面积93．2万亩。
中央已连续在3个“五年计划”里支持其建设，累计投入预算内基本建设资金25亿元。这是新中国成立以来国家对单一省区、单一农作物投资年限最长的项目。